Il y a quelques années, une rumeur avait fait surface concernant une possible relation amoureuse entre Figo, et son entraîneur de l'époque, Pep Guardiola. Si l'homosexualité est encore un sujet tabou dans le monde du football, l'ex-international portugais s'est exprimé à ce sujet et a tenu à démentir les rumeurs.
"Pour moi, Pep était un très bon ami. Une personne qui m’a beaucoup aidé lorsque je suis arrivé à Barcelone. C’était d’ailleurs mon camarade de chambre. Mais il n’y a jamais rien eu ! J’aime les femmes" a-t-il affirmé à ICON, une revue spécialisée du quotidien El Pais, avant d'évoquer le sujet de l'homosexualité dans le football, "Pourquoi aucun joueur de Liga n’a jamais avoué son homosexualité ? Les gens sont cruels. Tu joues tous les dimanches, et les gens vont t’attaquer là-dessus plutôt que sur ton rendement sportif."